近日，我院檢驗(yàn)科主任胡波教授團(tuán)隊(duì)與感染性疾病科崇雨田教授團(tuán)隊(duì)、生物治療中心張琪教授團(tuán)隊(duì)在數(shù)學(xué)與計(jì)算生物學(xué)領(lǐng)域高水平雜志Briefings in Bioinformatics （2021 IF: 8.9）發(fā)表了題目為“HCC subtypes based on the activity changes of immunologic and hallmark gene sets in tumor and nontumor tissues”的原創(chuàng)性成果。龔嬌、李榮為論文的共同第一作者，胡波、崇雨田、張琪教授為論文的共同通訊作者。

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肝細(xì)胞肝癌（hepatocellular carcinoma, HCC）是嚴(yán)重威脅人類(lèi)健康的惡性腫瘤，其發(fā)病率在各類(lèi)腫瘤中居于第五，死亡率居于第三。我國(guó)是HCC的高發(fā)區(qū)，每年約有40萬(wàn)新增病例，約占全球總新發(fā)病例的 40%。近年來(lái)，胡波教授團(tuán)隊(duì)一直從事肝臟疾病相關(guān)研究，致力于篩選出新的檢驗(yàn)指標(biāo)，更好地輔助疾病的診斷及預(yù)后的評(píng)估，為臨床提供支持。目前，HCC患者的預(yù)后評(píng)估主要基于腫瘤本身的性狀，而癌旁組織在預(yù)后中的作用尚不明確。

本研究首次發(fā)現(xiàn)，HCC和癌旁組織中免疫和標(biāo)志基因集的活性變化可以用于HCC患者的分型，且不同分型與患者的預(yù)后密切相關(guān)。亞型1的患者預(yù)后顯著好于亞型2和亞型3。研究還進(jìn)一步篩選并驗(yàn)證了與預(yù)后緊密相關(guān)的3個(gè)腫瘤基因集、4個(gè)癌旁基因集。功能富集分析發(fā)現(xiàn)，4個(gè)癌旁基因集中的基因與免疫反應(yīng)、細(xì)胞粘附等信號(hào)通路密切相關(guān)，可能影響轉(zhuǎn)移和復(fù)發(fā)，提示免疫治療時(shí)應(yīng)考慮癌旁組織的性狀；而3個(gè)腫瘤基因集中的基因則與細(xì)胞周期等通路密切相關(guān)，這與之前的研究一致?？偟膩?lái)說(shuō)，本研究首次在HCC領(lǐng)域綜合癌旁和癌組織的基因集的富集分?jǐn)?shù)，對(duì)患者進(jìn)行分型及預(yù)后評(píng)估，為HCC的治療提供了新的思路——在選擇HCC治療方式時(shí)，應(yīng)該綜合考慮癌旁及癌組織的變化。

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3個(gè)HCC亞型的代表性的免疫和標(biāo)志基因集的熱圖

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參考文獻(xiàn):

Gong J, Li R, Chen Y, Zhuo Z, Chen S, Cao J, Zhang Q, Chong Y, Hu B. HCC subtypes based on the activity changes of immunologic and hallmark gene sets in tumor and nontumor tissues. Brief Bioinform. 2021 Jan 30:bbaa427. doi: 10.1093/bib/bbaa427. Epub ahead of print. PMID: 33515024.

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